Caroline Clabecq
03/11/2026, 3:40 PMpath "versions.yml" , emit: versions_bff, topic: versions
i got this error :
2 Module Tests Failed ───────────────────────────────────────────────────────────────────╮
│ ╷ ╷ │
│ Module name │ File path │ Test message │
│╶────────────┼──────────────────────────────┼─────────────────────────────────────────────────╴│
│ bff │ modules/nf-core/bff/meta.yml │ correct_meta_outputs: Module meta.yml does not │
│ │ │ match main.nf. Outputs should contain: │
│ │ │ {'assignment': [['meta', │
│ │ │ '_assignment_bff.csv']], 'metrics': [['meta', │
│ │ │ '_metrics_bff.csv']], 'params': [['meta', │
│ │ │ '*_params_bff.csv']], 'versions_bff': │
│ │ │ ['versions.yml']} Run nf-core modules lint --fix │
│ │ │ to update the meta.yml file. │
│ bff │ modules/nf-core/bff/main.nf │ wrong_version_output: Versions topic output is │
│ │ │ not correctly formatted, expected tuple │
│ │ │ val("${task.process}"), val('<tool>'), │
│ │ │ eval("<version_command>") or tuple │
│ │ │ val("${task.process}"), val('<tool>'), │
│ │ │ val('<version>') │
│ ╵ ╵ │
╰───────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╯Marcel Ribeiro-Dantas
03/11/2026, 6:32 PMmashehu
03/11/2026, 7:56 PMCaroline Clabecq
03/12/2026, 11:37 AMCaroline Clabecq
03/12/2026, 11:37 AMmashehu
03/12/2026, 11:38 AMpip install --upgrade --force-reinstall git+<https://github.com/nf-core/tools.git@dev> (we use that for CI linting)Caroline Clabecq
03/12/2026, 11:45 AM