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                                        ,--./,-.
        ___     __   __   __   ___     /,-._.--~'
  |\ | |__  __ /  ` /  \ |__) |__         }  {
  | \| |       \__, \__/ |  \ |___     \`-._,-`-,
                                        `._,._,'
  nf-core/metatdenovo v1.0.1-g10eab6d
------------------------------------------------------
Core Nextflow options
  revision       : master
  runName        : sick_torvalds
  containerEngine: docker
  launchDir      : /home/erick/Nextflow/nf-core_metatdenovo
  workDir        : /home/erick/Nextflow/nf-core_metatdenovo/work
  projectDir     : /root/.nextflow/assets/nf-core/metatdenovo
  userName       : root
  profile        : docker
  configFiles    :

Input/output options
  input          : samplesheet.tsv

Assembler options
  assembler      : rnaspades

Orf Caller options
  orf_caller     : prokka

Taxonomy annotation options
  eukulele_db    : gtdb

!! Only displaying parameters that differ from the pipeline defaults !!
------------------------------------------------------
If you use nf-core/metatdenovo for your analysis please cite:

* The nf-core framework
  <https://doi.org/10.1038/s41587-020-0439-x>

* Software dependencies
  <https://github.com/nf-core/metatdenovo/blob/master/CITATIONS.md>

executor >  local (114)
[01/06bf28] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:INPUT_CHECK:SAMPLESHEET_CHECK (samplesheet.tsv)                        [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[-        ] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:CAT_FASTQ                                                              -
[d9/4bed40] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:FASTQC_TRIMGALORE:FASTQC (Sample4)                                     [100%] 8 of 8 :heavy_check_mark:
[f3/0bdf39] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:FASTQC_TRIMGALORE:TRIMGALORE (Sample2)                                 [100%] 8 of 8 :heavy_check_mark:
[f8/95212d] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:SEQTK_MERGEPE (Sample3)                                                [100%] 8 of 8 :heavy_check_mark:
[03/a59b32] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:WRITESPADESYAML (spades.yaml)                                          [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[70/42a28e] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:SPADES (rnaspades)                                                     [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[60/686d4f] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:FORMATSPADES (rnaspades)                                               [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[3e/0b91b1] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:PROKKA_SUBSETS:PROKKA (rnaspades.format_header.transcript.17)          [100%] 18 of 18 :heavy_check_mark:
[60/7dfda4] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:PROKKA_SUBSETS:GFF_CAT (rnaspades.prokka)                              [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[6d/e1e29a] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:PROKKA_SUBSETS:FAA_CAT (rnaspades.prokka)                              [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[92/e938a8] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:PROKKA_SUBSETS:FFN_CAT (rnaspades.prokka)                              [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[51/39a498] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:PROKKA_SUBSETS:PROKKAGFF2TSV (rnaspades.prokka)                        [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[e1/e3d6a0] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:UNPIGZ_GFF (prokka.gff.gz)                                             [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[8c/ab220e] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:BBMAP_INDEX (rnaspades.format_header.transcript.fa.gz)                 [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[b1/f4e20e] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:BBMAP_ALIGN (Sample6)                                                  [100%] 8 of 8 :heavy_check_mark:
[-        ] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:HMMCLASSIFY:HMMER_HMMSEARCH                                            -
[-        ] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:HMMCLASSIFY:HMMRANK                                                    -
[8b/a3d1d8] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:BAM_SORT_STATS_SAMTOOLS:SAMTOOLS_SORT (Sample6)                        [100%] 8 of 8 :heavy_check_mark:
[6a/f47a1a] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:BAM_SORT_STATS_SAMTOOLS:SAMTOOLS_INDEX (Sample6)                       [100%] 8 of 8 :heavy_check_mark:
[b2/951eb4] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:BAM_SORT_STATS_SAMTOOLS:BAM_STATS_SAMTOOLS:SAMTOOLS_STATS (Sample3)    [ 75%] 6 of 8
[9f/49cfd1] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:BAM_SORT_STATS_SAMTOOLS:BAM_STATS_SAMTOOLS:SAMTOOLS_FLAGSTAT (Sample8) [100%] 8 of 8 :heavy_check_mark:
[f1/d8eec7] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:BAM_SORT_STATS_SAMTOOLS:BAM_STATS_SAMTOOLS:SAMTOOLS_IDXSTATS (Sample8) [100%] 8 of 8 :heavy_check_mark:
[98/b7898f] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:FEATURECOUNTS_CDS (Sample6)                                            [100%] 8 of 8 :heavy_check_mark:
[7c/fedf15] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:COLLECT_FEATURECOUNTS (rnaspades.prokka)                               [  0%] 0 of 1
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[cb/3ff2ba] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:EGGNOG:EGGNOG_MAPPER (rnaspades.prokka)                                [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[-        ] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:EGGNOG:EGGNOG_SUM                                                      -
[skipped  ] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:KOFAMSCAN:KOFAMSCAN_DOWNLOAD (KEGG data)                               [100%] 1 of 1, stored: 1 :heavy_check_mark:
[b0/3b90e4] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:KOFAMSCAN:KOFAMSCAN_SCAN (rnaspades.prokka)                            [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[-        ] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:KOFAMSCAN:SUM_KOFAMSCAN                                                -
[97/3ba13e] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:UNPIGZ_CONTIGS (rnaspades.format_header.transcript.fa.gz)              [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[2b/95a72b] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:TRANSRATE (rnaspades)                                                  [100%] 1 of 1 :heavy_check_mark:
[b5/d67099] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:SUB_EUKULELE:EUKULELE_SEARCH (rnaspades.prokka)                        [  0%] 0 of 1
[-        ] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:SUB_EUKULELE:FORMAT_TAX                                                -
[-        ] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:SUB_EUKULELE:SUM_TAXONOMY                                              -
[-        ] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:MERGE_TABLES                                                           -
[-        ] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:COLLECT_STATS                                                          -
[-        ] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:CUSTOM_DUMPSOFTWAREVERSIONS                                            -
[-        ] process > NFCORE_METATDENOVO:METATDENOVO:MULTIQC                                                                -