I have "PermissionError: [Errno 13] Permission den...
# ask-elementary-ai
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I have "PermissionError: [Errno 13] Permission denied: '/.edr'" error when I try to execute edr send-report command through a docker container execute on Airflow pod
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@kapa.ai Elementary is already installed in docker image
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A message from kapa.ai
I understand that Elementary is already installed in your Docker image. In this case, the permission error you're experiencing is likely because the user running the
edr
command inside the container doesn't have write permissions to certain directories that Elementary needs to access. Based on the knowledge sources, when Elementary runs, it needs to: 1. Access its internal dbt project 2. Write to directories like
dbt_packages
or create log files 3. Create temporary files in the
.edr
directory Here are some solutions specifically for cases where Elementary is already installed: ### Solution 1: Change permissions for the Elementary directories In your Dockerfile, you can add a command to change permissions for the Elementary directories:
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dockerfile RUN chown -R youruser /usr/local/lib/python3.8/site-packages/elementary
This was successful for users with similar issues as mentioned in the [Slack discussion](https://slack.com/archives/C02CTC89LAX/p1685408463792899). ### Solution 2: Pre-install dbt packages during image build Even though Elementary is installed, you might need to pre-install its dbt packages:
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dockerfile RUN cd $(python -c "import os; from elementary.monitor import dbt_project_utils; print(os.path.dirname(os.path.realpath(dbt_project_utils.__file)))") \     /dbt_project && dbt deps
This ensures the packages are already installed when you run the container. ### Solution 3: Create a writable directory for Elementary You could create a writable directory specifically for Elementary to use:
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bash mkdir -p /opt/airflow/dbt-dir/edr
And then specify this directory when running Elementary commands:
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bash edr send-report --config-dir /opt/airflow/dbt-dir/edr
If you're still experiencing issues, it would be helpful to know more about your specific container setup, the user that's running the
edr
command, and any specific security constraints in your environment.
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@kapa.ai Ok, when I run edr send-report command, elementary installing edr internal dbt package, how can I force to not install this package ?
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A message from kapa.ai
I understand your issue. When running
edr send-report
, Elementary tries to install its internal dbt package, which is causing problems in your environment. Based on the knowledge sources, Elementary checks if its dependencies are up-to-date and runs
dbt deps
only if they're not already installed. However, in environments with read-only filesystems or restricted internet access, this can cause errors. Here are solutions to prevent Elementary from installing the internal dbt package: ### Pre-install the packages in your Docker image The most reliable solution is to pre-install the packages during your Docker image build:
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dockerfile RUN dbt deps --project-dir /usr/local/lib/python3.8/site-packages/elementary/monitor/dbt_project --profiles-dir /root/.dbt
Make sure to adjust the paths to match your specific installation location. This approach was successful for users with similar issues [in this discussion](https://slack.com/archives/C02CTC89LAX/p1697103899679929). ### Alternative approach for offline environments If you're in an environment without internet access, you can: 1. Copy the required packages (elementary and dbt_utils) directly into the internal dbt project's packages directory:
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../site-packages/elementary/monitor/dbt_project/dbt_packages/
2. This was confirmed to work for offline environments [in this discussion](https://slack.com/archives/C02CTC89LAX/p1679910207387459). Unfortunately, there isn't a simple flag to disable this behavior completely. The
--update-dbt-package=False
flag exists but doesn't prevent the initial package installation if the packages aren't already present. The root cause is that Elementary's CLI has an internal dbt project that needs these packages to function properly, and it checks for their existence before proceeding. Let me know if you need more specific guidance based on your environment setup! [Slack forum discussion](https://slack.com/archives/C02CTC89LAX/p1697103899679929) [Offline environment solution](https://slack.com/archives/C02CTC89LAX/p1679910207387459)
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@kapa.ai A quoi sert le paramètre "--profiles-dir /root/.dbt" dans la commande que tu m'as envoyée ?
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A message from kapa.ai
Le paramètre
--profiles-dir /root/.dbt
dans la commande
dbt deps --project-dir /usr/local/lib/python3.8/site-packages/elementary/monitor/dbt_project --profiles-dir /root/.dbt
indique à Elementary Data où trouver le fichier
profiles.yml
. Ce paramètre est essentiel car: 1. Il spécifie le répertoire contenant le fichier
profiles.yml
qui stocke les informations de connexion à votre entrepôt de données (comme Snowflake, BigQuery, etc.) 2. Par défaut, Elementary cherche ce fichier dans
~/.dbt/
(le répertoire
.dbt
dans le répertoire personnel de l'utilisateur), mais dans un environnement Docker, ce chemin peut être différent ou inaccessible 3. Sans ce paramètre, vous pourriez rencontrer des erreurs comme:
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Error: Invalid value for '--profiles-dir': Path '/root/.dbt' does not exist.
ou
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Could not find profile named 'elementary'
Comme indiqué dans la [documentation d'Elementary](https://docs.elementary-data.com/oss/cli-commands#cli-options), ce paramètre est particulièrement important dans les environnements conteneurisés où les chemins par défaut peuvent ne pas exister ou être accessibles. Si votre fichier
profiles.yml
se trouve à un autre emplacement dans votre conteneur, vous devrez ajuster ce chemin en conséquence. [Plusieurs discussions dans le forum Slack](https://slack.com/archives/C02CTC89LAX/p1669047039586539) montrent que ce paramètre est souvent nécessaire pour résoudre les problèmes de configuration dans des environnements Docker.
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@kapa.ai I get the following error "Traceback (most recent call last):\n File \"/usr/local/lib/python3.11/site-packages/dbt/cli/requires.py\", line 138, in wrapper\n result, success = func(*args, **kwargs)\n ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^\n File \"/usr/local/lib/python3.11/site-packages/dbt/cli/requires.py\", line 101, in wrapper"
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A message from kapa.ai
Je vois que vous rencontrez une erreur de permission lors de l'exécution d'Elementary Data. Cette erreur est similaire aux problèmes que nous avons discutés précédemment. L'erreur indique que lors de l'exécution de
dbt deps
(qui est lancé automatiquement par Elementary), le système essaie de supprimer le répertoire
dbt_expectations
existant avant de le réinstaller, mais n'a pas les permissions nécessaires pour le faire. Voici les solutions possibles : ### 1. Modifier les permissions des répertoires Vous pouvez ajouter une commande dans votre Dockerfile pour changer les permissions du répertoire d'installation d'Elementary :
Copy code
dockerfile RUN chmod -R 777 /usr/local/lib/python3.11/site-packages/elementary/monitor/dbt_project
Cette solution a fonctionné pour d'autres utilisateurs ayant des problèmes similaires, comme mentionné dans [cette discussion Slack](https://slack.com/archives/C02CTC89LAX/p1696246081105209). ### 2. Utiliser une variable d'environnement pour changer l'emplacement des packages Un utilisateur a découvert qu'il est possible de contrôler où Elementary installe ses dépendances dbt avec la variable d'environnement
DBT_PACKAGES_FOLDER
:
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bash export DBT_PACKAGES_FOLDER=/tmp/edr_dbt_packages
Cela permettrait d'installer les packages dans un répertoire où vous avez les permissions d'écriture, comme mentionné dans [cette discussion](https://slack.com/archives/C02CTC89LAX/p1716798424976069). ### 3. Préinstaller les packages dans l'image Docker Comme nous l'avons discuté précédemment, vous pouvez préinstaller les packages dbt dans votre image Docker :
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dockerfile RUN dbt deps --project-dir /usr/local/lib/python3.11/site-packages/elementary/monitor/dbt_project --profiles-dir /chemin/vers/votre/profiles
Cette approche évite que Elementary n'essaie de réinstaller les packages lors de l'exécution. ### 4. Exécuter avec des privilèges plus élevés Si vous êtes dans un environnement où c'est possible, vous pourriez exécuter la commande avec
sudo
:
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bash sudo edr send-report [vos options]
Cette erreur est typique des environnements conteneurisés où les permissions sont restreintes. La solution la plus propre dépendra de votre configuration spécifique et des contraintes de sécurité de votre environnement.
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Je vois que vous continuez à rencontrer des erreurs avec Elementary Data. L'erreur que vous partagez est tronquée, mais elle semble être liée au même problème de permission que nous avons discuté précédemment. D'après les sources de connaissances, cette erreur se produit généralement lorsque Elementary tente d'exécuter la commande
dbt deps
pour installer ou mettre à jour ses packages internes. Dans les environnements conteneurisés comme Docker ou Databricks, cela peut échouer en raison de restrictions de permission. Voici les solutions possibles basées sur les cas similaires documentés : ### 1. Utiliser l'option
--update-dbt-package false
Certains utilisateurs ont résolu ce problème en ajoutant cette option à leur commande :
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bash edr report --update-dbt-package false [autres options]
Cela a été mentionné dans [un problème GitHub](https://github.com/elementary-data/elementary/issues/1584) comme solution possible. ### 2. Modifier les permissions du répertoire d'installation
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bash chmod -R 777 /usr/local/lib/python3.11/site-packages/elementary/monitor/dbt_project
### 3. Préinstaller les packages dans un emplacement accessible en écriture
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bash mkdir -p /tmp/elementary_packages export DBT_PACKAGES_FOLDER=/tmp/elementary_packages dbt deps --project-dir /usr/local/lib/python3.11/site-packages/elementary/monitor/dbt_project
### 4. Utiliser une version spécifique d'Elementary Certains utilisateurs ont signalé des problèmes avec des versions spécifiques. Vous pourriez essayer de revenir à une version antérieure ou de passer à la dernière version :
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bash pip install elementary-data==0.13.0
Si vous pouvez partager l'erreur complète ou plus de détails sur votre environnement, je pourrais vous fournir des conseils plus spécifiques. Les problèmes de permission sont courants avec Elementary dans des environnements conteneurisés, et la solution exacte dépend souvent de la configuration spécifique de votre environnement.
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@kapa.ai Where can I declare DBT_TARGET_PATH variable ?
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A message from kapa.ai
Vous pouvez déclarer la variable d'environnement
DBT_TARGET_PATH
de plusieurs façons, selon votre environnement d'exécution: ### 1. Dans un terminal (avant d'exécuter la commande edr)
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bash export DBT_TARGET_PATH=/chemin/vers/votre/dossier/target edr send-report [vos options]
### 2. En ligne avec la commande edr
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bash DBT_TARGET_PATH=/chemin/vers/votre/dossier/target edr send-report [vos options]
### 3. Dans votre Dockerfile
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dockerfile ENV DBT_TARGET_PATH=/chemin/vers/votre/dossier/target
### 4. Dans votre configuration Airflow (si vous utilisez Airflow)
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python # Dans votre DAG task = BashOperator(     task_id='elementary_task',     bash_command='edr send-report [options]',     env={'DBT_TARGET_PATH': '/chemin/vers/votre/dossier/target'}, )
Cette variable est particulièrement importante car Elementary l'utilise pour localiser les artefacts générés par dbt, comme le fichier
sources.json
pour les commandes de fraîcheur des sources. Comme mentionné dans [cette discussion Slack](https://slack.com/archives/C02CTC89LAX/p1694700068197439), si votre
target-path
dans
dbt_project.yml
utilise des expressions Jinja comme:
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yaml target-path: "{{env_var('DBT_TARGET_PATH', 'target')}}"
Elementary ne peut pas interpréter correctement cette expression Jinja et a besoin que la variable d'environnement soit définie explicitement. Si vous rencontrez toujours des problèmes après avoir défini cette variable, vous pourriez également avoir besoin de spécifier le chemin du projet avec
--project-dir
et le répertoire des profils avec
--profiles-dir
.
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@kapa.ai Can I see all results of elementary dbt test on the UI from elementary OSS or I'm limited to only 5 results ?
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